Эноксапарин используется для предотвращения тромбоза глубоких вен и легочной эмболии; лечить имеющийся венозный тромбоз; предотвратить образование тромбов в экстракорпоральном кровообращении при гемодиализе; для лечения нестабильной стенокардии и инфаркта миокарда без зубца Q. Его натриевая соль эноксапарин натрия используется в клинической практике.